1. 该程序用于将Materials Studio导出的.pdb文件转化为LAMMPS使用的.data文件;
2. 文件"elements-message"需要填写体系元素信息，相关顺序应该与力场/控制文件的顺序一致;
3. elements-message建议用记事本编辑，不要用Notepad++，该文 档应与程序在同一目录下;
4. 文件名需要用英文输入，请注意转换输入法;
5. 如有意见与建议请联系 2468912515@qq.com;
6. 希望对你有用;
7. 如果你是专业做模拟的，建议您独自编写脚本。
---2020年7月14日
1. 程序只能处理正交模拟体系；
2. 体系最后1行会多出1个空行；
3. 待处理文件、elements-message文件、程序应在同一目录下。
3. 体系所有原子的电荷都设置为0，因LAMMPS一般会重新计算电荷。
4. elements-message文件的编写方式：
4-1. 第1行为用到的元素个数n；
4-2. 之后n行为n种元素，及其相对分子质量；
4-3. 例中所示的情况6 N 14.0067是不会被读取的。
5
1 C 12.0000
2 H 1.0080
3 O 15.9990
4 Si 28.0855
5 Al 26.9815
6 N 14.0067
---2020年7月15日
[by-llma] 将Materials Studio中的pdb文件转化为LAMMPS需要的data坐标文件的小程序
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2020-07-15
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readme.txt 1KB test.pdb_data.lmps 211KB elements-message 80B资源评论
土壤_CHY2020-10-26不能用...输入.pdb文件名后，无法输出lammps可读的输入文件
