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crossmap:在装配体之间转换基因组坐标-开源
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2021-04-29
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共52个文件
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gz:14个
txt:5个
CrossMap是一个程序,用于在程序集之间方便地转换基因组坐标和基因组注释文件(例如,从GRCh36 / hg18提升到GRCh37 / hg19或反之亦然)。它支持BAM,SAM,BED,Wiggle,BigWig,GFF,GTF格式的文件。
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CrossMap-0.2.5.tar.gz (52个子文件)
CrossMap-0.2.5
MANIFEST.in 232B
PKG-INFO 757B
README.rst 43KB
bin
CrossMap.py 60KB
distribute_setup.py 15KB
data
hg19ToGRCh37.over.chain.gz 2KB
hg38ToHg19.over.chain.gz 1.19MB
mm9ToMm10.over.chain.gz 523KB
hg17ToHg19.over.chain.gz 147KB
hg19ToHg17.over.chain.gz 341KB
mm9ToMm8.over.chain.gz 1.17MB
GRCh37ToHg19.over.chain.gz 2KB
hg19ToHg18.over.chain.gz 221KB
mm10ToMm9.over.chain.gz 940KB
hg18ToHg17.over.chain.gz 231KB
hg19ToHg38.over.chain.gz 222KB
hg17ToHg18.over.chain.gz 83KB
hg18ToHg19.over.chain.gz 137KB
hg18ToHg38.over.chain.gz 336KB
setup.cfg 59B
doc
README.txt 78B
setup.py 1KB
lib
CrossMap.egg-info
PKG-INFO 757B
requires.txt 28B
not-zip-safe 1B
SOURCES.txt 1KB
top_level.txt 20B
dependency_links.txt 1B
cmmodule
wig_reader.py 3KB
mystat.py 5KB
cigar.py 4KB
fickett.py 3KB
wiggle.py 6KB
annoGene.py 9KB
poisson.py 537B
ireader.py 679B
__init__.py 196B
fastq.py 846B
BED.py 85KB
orf.py 3KB
fasta.py 7KB
sam_header.py 2KB
changePoint.py 1KB
twoList.py 2KB
dotProduct.py 2KB
SAM.py 151KB
bam_cigar.py 4KB
quantile.py 2KB
myutils.py 469B
bgrMerge.py 3KB
PSL.py 5KB
psyco_full.py 194B
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cocoaitea
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