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Humanized-mice-model_DNA-seq_analysis
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2021-05-07
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人源化小鼠模型_DNA序列分析 概述 我们正在使用Bowtie2软件将DNA-seq与人类基因组和小鼠基因组进行比对。 完成比对后,我们将删除那些映射到人和小鼠基因组的读段,然后使用软件管道MetAMOS对其余的读段进行组装,基因预测和分类分类。 当我们减去与小鼠和人类数据一致的序列时,我们正在研究微生物序列,将通过MetAMOS对其进行分析。 那些仅与人基因组匹配的序列可用于表征人源化小鼠模型。 背景: 现在,人们坚信,HIV发病机制的初始阶段依赖于肠道中的微生物移位,从而驱动了HIV / SIV所需的全身性炎症。 假设:EcoHIV是一种可以感染小鼠细胞的经过修饰的HIV,它将在系统水平上概述HIV-1的早期后果,例如细菌易位,并询问感染与Appium的组合是否会使这些症状恶化。 人源化小鼠模型: 大多数感染模型都集中在“人性化”小鼠上,要么通过创建具有人类HIV共同受体的转基因
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清木一阳
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