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mlst:根据PubMLST输入方案扫描重叠群文件
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2021-05-16
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st 根据传统的PubMLST输入方案扫描contig文件 快速开始 % mlst contigs.fa contigs.fa neisseria 11149 abcZ(672) adk(3) aroE(4) fumC(3) gdh(8) pdhC(4) pgm(6) % mlst genome.gbk.gz genome.gbk.gz sepidermidis 184 arcC(16) aroE(1) gtr(2) mutS(1) pyrR(2) tpiA(1) yqiL(1) % mlst --label Anthrax GCF_001941925.1_ASM194192v1_genomic.fna.bz2 Anthrax bcereus - glp(24) gmk(1) ilv(~83) pta(1) pur(~71) pyc(37) tpi(41) % mls
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