patchseqtools:patch-seq 转录组学数据的 QC 和细胞类型分配

Allen Institute Patch-seq 文档和工具 Patch-seq 是一种强大的技术，可以对单个神经元进行多模式表征——电生理学、形态学和转录组学。 在艾伦研究所，我们优化了这项技术以有效收集高质量数据。 在此 GitHub 存储库中，我们提供了描述此优化技术和相关数据的手稿链接、详细协议、使用此技术的艾伦研究所手稿以及艾伦研究所资源和软件的链接。 此外，这个 repo 包括一个 R 包用于 Patch-seq 细胞的质量控制和细胞分型。 protocol.io 上的 Patch-seq 详细协议 缩放、高保真电生理学、形态学和转录组学细胞表征 多通道 Igor 电生理套件 (MIES) Github 存储库 艾伦研究所 Patch-seq 论文 鼠标视觉皮层 人类 L2/3 - 艾伦研究所细胞类型网络产品 Morpho-Electric 数据库 单细胞 RNA-se