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Trinity_CTAT
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2021-05-02
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三位一体癌症转录组分析工具包(CTAT) 三位一体癌症转录组分析工具包(CTAT)旨在提供利用RNA-Seq的工具,以深入了解癌症转录组的生物学特性。 提供了生物信息学工具支持,用于突变检测,融合转录本鉴定,癌症特异性转录本的从头转录本组装,lincRNA分类和外来转录本检测(病毒,微生物)。 CTAT由美国国家癌症研究所癌症研究信息技术(NCI ITCR)计划资助。 有关Trinity CTAT中模块的描述,请访问我们的 。 每个Trinity CTAT模块在上面都组织为一个子模块,您可以单击该子模块轻松访问相关的代码和文档。
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Trinity_CTAT-master.zip (2个子文件)
Trinity_CTAT-master
Fusion-Transcript-Prediction
TrinityFusion
FusionInspector
STAR-Fusion
Virus-Integration-Sites
CTAT-VirusIntegrationFinder
Tumor-Copy-Number-Aberrations
infercnv
Wiki
Trinity_CTAT.wiki
.gitmodules 3KB
README.md 842B
Cancer-Splicing-Aberrations
CTAT-SPLICING
RNAseq-Assembly
DISCASM
trinityrnaseq
Mutations-via-RNAseq
ctat-mutations
共 2 条
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