## Get-Uniprot: A Simple Python CLI for Grabbing Protein Sequences. ����
![](/assets/get-uniprot.gif)
### Prerequisites:
- Python >=3.6
### Quickstart:
```
pip install get-uniprot
```
### Usage:
```
Usage: uniprot [OPTIONS] QUERY
Arguments:
QUERY The Protein Name.
Options:
-o, --organism TEXT Name of organism.
-f, --file Output sequence to .fasta file.
--help Show this message and exit.
```
e.g.
```
uniprot -q eEF1A -o 'S. cerevisiae' > eEF1A.fasta
```
### Output:
Command will output sequence to the shell and create a .fasta file in the current directory if -f supplied.
Otherwise can redirect to file (see example.)
Recommended: Use -f option if in Windows PowerShell, redirects will create abhorrently formatted .fasta sequences.
没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
get-uniprot:使用Uniprot API捕获查询蛋白序列的简单Python CLI
共8个文件
py:3个
gz:1个
gif:1个
需积分: 47 2 下载量 67 浏览量
2021-04-13
05:54:20
上传
评论 1
收藏 426KB ZIP 举报
温馨提示
Get-Uniprot:用于获取蛋白质序列的简单Python CLI。 :dna: 先决条件: Python> = 3.6 快速开始: pip install get-uniprot 用法: Usage: uniprot [OPTIONS] QUERY Arguments: QUERY The Protein Name. Options: -o, --organism TEXT Name of organism. -f, --file Output sequence to .fasta file. --help Show this message and exit. 例如 uniprot -q eEF1A -o 'S. cerevisiae' > eEF1A.fasta 输出: 如果提供-f,命令将向外壳输出序列,
资源详情
资源评论
资源推荐
收起资源包目录
get-uniprot-main.zip (8个子文件)
get-uniprot-main
getUniprot
__init__.py 0B
uniprot.py 2KB
assets
get-uniprot.gif 450KB
dist
get-uniprot-1.1.2.tar.gz 2KB
setup.py 777B
.gitignore 11B
README.md 799B
LICENSE.txt 1KB
共 8 条
- 1
婉君喜欢DIY
- 粉丝: 13
- 资源: 4617
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
最新资源
- 天气预报爬虫 (WeatherCrawler) 介绍:这个脚本可以爬取天气预报网站上的天气信息,如温度、湿度、风速等,并打印出来
- ticket.jpeg
- 邮件爬虫 (EmailCrawler) 介绍:这个脚本可以爬取特定网页上的电子邮件地址,并打印出来
- 电商爬虫 (EcommerceCrawler) 介绍:这个脚本可以爬取电商网站上的商品信息,如商品名称、价格等,并打印出来
- 论坛爬虫 (ForumCrawler) 这个脚本可以爬取论坛上的帖子标题和链接,并打印出来
- 第十五届蓝桥杯单片机第一场代码
- Python 正则表达式.docx
- 微博爬虫 (WeiboCrawler) 介绍:这个脚本可以爬取微博用户的最新微博内容,并打印出来
- 介绍:这个脚本可以爬取新闻网站上的新闻标题和链接,并打印出来
- 1_OAM基础知识.pdf
资源上传下载、课程学习等过程中有任何疑问或建议,欢迎提出宝贵意见哦~我们会及时处理!
点击此处反馈
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功
评论0