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ClusterPathways:给定一个分类单元集群,找到该集群中各对分类单元共享的所有路径
共8个文件
txt:3个
expected:1个
py:1个
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2021-02-13
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集群路径 语言:Python 输入:TXT 输出:TXT 经过测试:PluMA 1.1,Python 3.6 依赖关系:路径工具数据库 PluMA插件可获取一个类群,并从PathwayTools数据库(Karp等人,2015年)中搜索React,以搜索该类群。 它以TXT格式返回路径。 输入是制表符分隔的关键字/值对的参数TXT文件:noafile:分类群(NOA)路径簇:PathwayTools中路径的TXT文件 注意:示例文件夹仅包含群集NOA文件和参数TXT文件,而不包含路径文件,因为其中包含来自PathwayTools数据库的信息。 但是,如果您安装了PathwayTools,则“ PathwayTools”插件( )将为该路径生成此TXT文件。
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ClusterPathways-master.zip (8个子文件)
ClusterPathways-master
example
clusterpathways.txt.expected 8KB
config.txt 118B
pathwayinfo2.txt 67KB
parameters.txt 111B
clusters.noa 4KB
LICENSE 1KB
README.md 790B
ClusterPathwaysPlugin.py 3KB
共 8 条
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syviahk
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