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MSTgold:通过统计引导程序估计最小生成树-开源
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2021-04-29
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最小生成树(MST)算法可以生成多个相等最小的MST,但是MST程序通常仅报告一个任意选择的MST。 同样,大多数MST程序也不提供统计指标来支持他们估计的MST的可信度。 MSTgold估计替代MST的数量,报告用户确定的那些树的数量,报告共识树,并实施自举指标来评估替代MST解决方案的可靠性。 MSTgold接受单字符数据,即核苷酸,氨基酸,二进制字符或SNP。 整数,表示例如VNTR或微卫星的长度; 和距离矩阵。 MSTgold软件包包括MSTgold程序的Mac OS X,Linux和Windows可执行文件,详细的手册,示例数据和结果以及Fasta2MSTG程序的可执行文件,该程序将Fasta序列文件转换为MSTgold输入格式。
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孙洋Sonya
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