没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
qpbrute:拟合qpGraph模型的启发式搜索算法
共21个文件
py:7个
r:2个
md:2个
需积分: 45 0 下载量 54 浏览量
2021-03-18
00:49:22
上传
评论
收藏 2.28MB ZIP 举报
温馨提示
qpBrute 该存储库包含用于自动拟合混合图(带有 ),使用启发式算法来迭代拟合日益复杂的模型的Python代码,以及用于计算贝叶斯因子(带有 )以比较拟合模型的R代码。 该启发式搜索算法首先”一文中进行了描述。 该代码随后被重构以形成一个独立的工具,包括贝叶斯因子计算,该论文。 给定一个用于生成图的外部组,使用逐步添加顺序算法将叶节点添加到图。 在每个步骤中,都会在图的所有分支(外组分支除外)上测试新节点的插入。 如果无法插入节点而不产生f4离群值(即| Z |> = 3),那么还将尝试所有可能的混合组合。 如果无法通过任何一种方法插入节点,则该子图将被丢弃。 如果成功插入节点,则将其余节点递归插入到该图中。 尝试所有可能的起始节点顺序,以确保最大程度地覆盖图形空间。 拟合图的结果列表然后传递到在R程序包中实现的MCMC算法,以计算模型及其贝叶斯因子(BF)的边际可能性。 引文
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
qpbrute-master.zip (21个子文件)
qpbrute-master
MANIFEST.in 61B
qpbrute
rscript
model_likelihood.R 8KB
bayes_factors.R 4KB
consts.py 1KB
qpcluster.py 8KB
utils.py 4KB
qpbayes.py 11KB
qpbrute.py 29KB
__init__.py 0B
test
sim1.geno 3MB
sim1.png 120KB
sim1.ind 11KB
sim1.snp 2.91MB
sim1.pops 70B
sim1.par 203B
requirements.txt 105B
LICENSE.md 1KB
setup.py 1008B
README.md 6KB
.gitignore 246B
environment.yaml 619B
共 21 条
- 1
资源评论
Tsy.H
- 粉丝: 19
- 资源: 4607
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
最新资源
- apk.tw_LineLite_v8a_v.2.17.1_sign.apk
- Elasticsearch实战:构建高效搜索系统的秘诀.zip
- HTML+CSS+JS网页设计:从入门到精通.zip
- 数据库课程设计:从理论到实践的全面指南.zip
- Python闭包:深入理解与应用场景解析.zip
- Win64OpenSSL-3-3-0.exe
- 课高分程设计-基于C++实现的民航飞行与地图简易管理系统-南京航空航天大学
- 航天器遥测数据故障检测系统python源码+文档说明+数据库(课程设计)
- 北京航空航天大学操作系统课设+ppt+实验报告
- 基于Vue+Echarts实现风力发电机中传感器的数据展示监控可视化系统+源代码+文档说明(高分课程设计)
资源上传下载、课程学习等过程中有任何疑问或建议,欢迎提出宝贵意见哦~我们会及时处理!
点击此处反馈
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功