D-PPIN:动态蛋白质-蛋白质相互作用网络数据集

密码 D-PPIN是一个动态网络数据集，由12个不同的酵母细胞动态蛋白质-蛋白质相互作用网络组成。 D-PPIN的统计 在D-PPIN的每个动态网络（例如Krogan_LCMS）中，节点表示编码蛋白质的基因，边缘表示在某个时间戳记下的蛋白质-蛋白质相互作用，并且每个边缘都带有时间戳记（例如node_u，node_v，时间戳记，权重）。 D-PPIN的产生 简而言之，构建动态蛋白质-蛋白质相互作用网络需要两个组件。 第一个是静态蛋白质-蛋白质相互作用网络，第二个是该静态网络中每种蛋白质的时间感知基因表达值序列。 通过主动和共表达的蛋白质分析（如下图所示），构建了一个动态网络。 在此上可以找到用于构建D-PPIN的静态网络。 论文“ Tu BP，Kudlicki A，Rowicka M，McKnight SL。酵母代谢周期的逻辑：细胞过程的时间间隔。科学2005年11月”中的酵母瞬时基因表达