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pyvmd:适用于VMD的Python工具
共48个文件
py:25个
md:8个
dat:4个
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2021-05-15
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pyvmd 用于VMD的Python工具(视觉分子动力学) Pyvmd旨在为VMD提供高级pythonic接口。 要求 带有python支持的VMD 麻木 setuptools-仅用于安装 模拟-仅用于测试 安装 Pyvmd具有基于setuptools的标准setup.py 。 使用python setup.py install 。 用法 运行vmd -python以使用python shell启动VMD。 然后,您可以将pyvmd用作任何其他python库。 可以使用vmd -python -e my_script.py运行VMD的Python脚本。 您可以使用-args选项将参数传递给脚本。 文献资料 带有示例的文档可以在找到。 可以使用python的内置help功能找到API的详细文档。
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pyvmd-master.zip (48个子文件)
pyvmd-master
setup.py 1KB
pylintrc 792B
.gitignore 134B
Makefile 593B
.travis.yml 165B
LICENCE 34KB
setup.cfg 272B
README.md 770B
pyvmd
labels.py 6KB
representations.py 20KB
analyzer.py 4KB
atoms.py 15KB
__init__.py 57B
datasets.py 3KB
collectors.py 7KB
analysis.py 3KB
tests
data
water.1.dcd 4KB
geometry.dat 975B
dataset.dat 260B
coords.dat 975B
water.psf 2KB
rmsd.dat 546B
water.pdb 2KB
water.2.dcd 4KB
test_labels.py 16KB
__init__.py 688B
test_drawing_methods.py 39KB
test_collectors.py 4KB
utils.py 5KB
test_coloring_methods.py 10KB
test_representations.py 7KB
test_molecules.py 12KB
test_utils.py 2KB
test_analyzer.py 3KB
test_datasets.py 3KB
test_analysis.py 1KB
test_atoms.py 18KB
test_measure.py 3KB
molecules.py 11KB
measure.py 3KB
.gitattributes 174B
docs
measure.md 1KB
atoms.md 6KB
representations.md 4KB
molecules.md 3KB
README.md 193B
labels.md 2KB
analysis.md 4KB
共 48 条
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