genealogical-quantities:在 Wright-Fisher 和 Kingman 合并模型下计算各种系谱量

关于 包含几个程序，用于在 Kingman 的合并模型和随机交配的离散时间 Wright-Fisher 模型下计算各种系谱数量。 这些程序以及给定的文本文件用于生成本文中的结果： Bhaskar A.,​​ Clark AG, Song YS PNAS, 111(6):2385–239​​0, 2014 文件 freq_spectrum_hybrid.cpp -- 使用WF模型计算前几代的预期频谱，然后切换到更古老的聚结 wf_freq_spectrum.cpp -- 使用 WF 模型计算预期频谱 coal_freq_spectrum.cpp——使用聚结计算预期的频谱 coal_exp_lineages.cpp——计算样本的预期祖先数量作为聚结下的时间函数 exp_multiple_mergers.cpp -- 在 WF 模型下计算 k-mergers 的预期数量作为时间的函数 exp_