gsne:全局t分布随机邻居嵌入-源码

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gsne 全局t分布随机邻居嵌入 “ gsne”函数通过引入全局成本函数来修改MATLAB内置函数“ tsne”,并在输入中添加新的参数lambda; lambda控制全局成本函数的贡献,lambda = 0等效于tsne。 其他参数与tsne相同。 tsne函数在“ Alrorithm”选项中提供了两种可用算法:“精确”和快速版本“ barneshut”。 目前,全局成本函数仅在“精确”算法中实现,因此必须将gsne输入中的“算法”选项设置为“精确”才能使gsne有效。 在以下位置查看gsne算法的更多详细信息: 周元胜,塔季亚娜·夏皮使用全局t-SNE保留集群间数据结构。 BioRxiv 331611; 土井: : 演示版 我们提供了演示代码来生成合成数据和虹膜数据的gsne映射: gsne / Demo_synthetic.m gsne / Demo_iris.m 由于

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