没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
温馨提示
酵母-GEM:酿酒酵母的共有基因组规模的代谢模型 简要型号说明: 该库包含酿酒酵母的当前共有的基因组规模的代谢模型。 这是遗留项目的延续。 有关最新版本,请。 模型关键字: 创业板类别:种类; 用途:实验数据重建,多组学综合分析,计算机应变设计,模型模板; 领域:代谢网络重建; 模型类型:重建,策划; 模型源: YeastMetabolicNetwork; Omic来源:基因组学,代谢组学; 分类学:酿酒酵母; 代谢系统:一般代谢; 生物React器; 应变: S288C; 条件:有氧,葡萄糖受限,确定的培养基; 最后更新:2020-09-18 主要模型描述符: 分类 范本模型
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
酵母-GEM:酿酒酵母的共识GEM (137个子文件)
BiGGrxnDictionary_newIDs.csv 54KB
BiGGmetDictionary.csv 28KB
BiGGmetDictionary_newIDs.csv 20KB
BiGGrxnDictionary.csv 20KB
lipidAbbreviations.csv 769B
requirements.in 72B
dev-requirements.in 61B
BiGGidsCompliance.ipynb 16KB
cobrapy-compliance.ipynb 8KB
essentialGenes.m 67KB
checkrxnDirection.m 44KB
checkSmatrixMNX.m 23KB
getAllPath.m 15KB
mapKEGGID.m 12KB
modMetsandSmatrix.m 9KB
modifyID.m 9KB
addBiomassUpdate.m 9KB
SubstrateUsage.m 7KB
mapMNXMID.m 7KB
convertYmn2FBC2.m 7KB
UpdateDBnewRxn.m 6KB
addDBnewRxn.m 6KB
addFAEnewRxn.m 5KB
addBiologRxnToGEM.m 5KB
addMetabolomicsRxnToGEM.m 5KB
MissingTransDeadEnd.m 5KB
makeFormulasCompliant.m 5KB
checkRxnBalance.m 5KB
mapIDsViaMNXref.m 5KB
saveYeastModel.m 5KB
findInDB.m 4KB
addGapfillingRxnToGEM.m 4KB
fixBiomassComp.m 4KB
getMissingFields.m 4KB
GetMNXID.m 4KB
increaseVersion.m 4KB
growth.m 4KB
sumBioMass.m 4KB
display_rxnMetInfo.m 3KB
clusterBiomass.m 3KB
fitGAM.m 3KB
checkMetBalance.m 3KB
addSLIMErxns.m 3KB
anaerobicModel.m 3KB
changerxnDirection.m 3KB
changerxn.m 2KB
addiSce926changes.m 2KB
CheckEnergyProduction.m 2KB
addSBOterms.m 2KB
modelCorrections.m 2KB
minimal_Y6.m 2KB
CheckBalanceforSce.m 2KB
addDBNewGeneAnnotation.m 2KB
addTransNewGPR.m 2KB
takeOutFromFormula.m 2KB
get_lnRevIdx.m 2KB
findSubSystem.m 2KB
addConfidenceScores.m 2KB
scaleBioMass.m 1KB
updateMetaboliteAnnotation.m 1KB
downloadMNXdb.m 1KB
addGeneNames.m 1KB
rescalePseudoReaction.m 914B
findDuplicatedRxns.m 875B
updateMetaboliteFormula.m 875B
addBiGGidentifiers.m 770B
deleteRepeated.m 700B
changeRules.m 540B
loadYeastModel.m 527B
getNewIndex.m 446B
yeastGEM.mat 696KB
LICENSE.md 17KB
history.md 12KB
README.md 6KB
README.md 210B
README.md 199B
README.md 175B
README.md 145B
README.md 121B
README.md 79B
README.md 77B
README.md 55B
io.py 4KB
__init__.py 0B
swissprot.tsv 3.64MB
kegg.tsv 3.29MB
DBnewGeneAnnotation.tsv 924KB
MetaCyc_deltaG.tsv 368KB
rxnDirectionInfo.tsv 310KB
grpContribution_deltaG.tsv 288KB
TransRxnGeneAnnotation.tsv 188KB
modMetsandSmatrix.tsv 148KB
SGDgeneNames.tsv 81KB
metabolite_manual_curation.tsv 55KB
modifyID.tsv 49KB
DBnewrRxnMatrix.tsv 35KB
Biolog_newRxnMatrix.tsv 27KB
DBnewRxnProp.tsv 27KB
Yeast7.6MNXMetMappingList.tsv 26KB
DBnewRxnMetAnnotation.tsv 24KB
共 137 条
- 1
- 2
资源评论
陈菌菇
- 粉丝: 28
- 资源: 4553
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功