循环分析脚本
完整的分析流程
注意：将所有文件（包括.bedpe文件和hg38 gff文件）保留在一个目录中。 对于python脚本和Linux终端，请将其用作工作目录。
依赖关系：bedtools，Python> = 3.7，pandas> = 1.2.0
要复制此分析，
运行Common_Loop_generator.py脚本（最好在python IDE中运行）。 输出应该是一组.bed文件。
在Linux终端中运行以下命令：
bedtools window -a anyLoops_AML_1.bed -b hg38.gff -w 15000 > mapped_anyLoops_AML_1.csv
bedtools window -a anyLoops_AML_2.bed -b hg38.gff -w 15000 > mapped_anyLoops_AML_2.csv
bed
