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DeepDockingGUI
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2021-08-04
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DeepDockingGUI - v2.5.12 什么是深度对接? 深度对接 (DD) 是一种基于深度学习的工具,旨在加速基于对接的虚拟筛选。 有关 DD 背后流程的更多详细信息,请参阅我们的论文 ( )。 该存储库提供了一个基于 Autodock-GPU 对接的用户友好的开源 GUI 版本,允许在 SLURM 集群上运行和分析 DD 活动。 先决条件 远程计算机(云、集群等): 已安装 SLURM 工作负载管理器。 Autodock GPU 已安装(推荐版本: : ) Python/condaAnaconda 必须配置为允许使用 bash 脚本激活/停用环境。 OpenBabel用于 3d 构象生成。 如果您想改用openeye ,请按照以下步骤操作: obabel DeepDockingGUI\Docking\ProgressiveDocking\prepare_li
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DeepDockingGUI (143个子文件)
install-windows.bat 129B
oldSchool.css 20KB
.gitignore 405B
mainPage.html 24KB
test.html 3KB
login.html 1KB
bundle.js 1.47MB
startarun.js 18KB
models.js 17KB
progress.js 8KB
basics.js 6KB
topScoring.js 4KB
login.js 3KB
webpack.config.js 2KB
test.js 641B
index.js 182B
package-lock.json 647KB
package.json 2KB
settings.json 276B
LICENSE 1KB
bundle.js.map 2.55MB
README.md 11KB
README.md 516B
README.md 116B
README.md 63B
top_scoring_full.png 327KB
new_project_info.png 309KB
models_full.png 199KB
start_a_run_full.png 188KB
Progress.png 162KB
Monitor.png 151KB
progress_full.png 127KB
login_screen.png 51KB
DDGUI-DD.png 45KB
d2d023bf09910fa13a8d59977bad92dd.png 10KB
8a9e1648449beda9d58190f1bc4a749e.png 8KB
0638bec8443dd6e3385084884ed644a2.png 5KB
2a9beabef112cd5d9b57edafe04ecd82.png 435B
00b42403057e60520cb497d92556b982.png 427B
1f0710a4a9c764c4801a6b0bbd1f6744.png 407B
c2e5bc8f9058ad350eed2e2559c63174.png 403B
d3698da8e2bda9d79e1bb514e2d600fa.png 351B
backend.py 33KB
progressive_docking.py 21KB
process_gui_data.py 21KB
install.py 16KB
server.py 16KB
DDModel.py 15KB
Extracting_smiles.py 13KB
hyperparameter_result_evaluation.py 12KB
cluster_commands.py 11KB
slurm_job_manager.py 11KB
Models.py 10KB
simple_job_models.py 10KB
slurm_file_manager.py 6KB
overloaded_final_extraction.py 6KB
DataHistory.py 6KB
sampling.py 6KB
Extract_labels.py 5KB
transformer_layers.py 5KB
Extracting_morgan.py 5KB
Prediction_morgan_1024.py 5KB
phase_changer.py 5KB
EmailBot.py 4KB
optimize_models.py 4KB
DDMetrics.py 4KB
fast_top_hit_search.py 4KB
DDCallbacks.py 4KB
Parser.py 4KB
model_tuner.py 4KB
data_generator.py 3KB
final_extraction.py 3KB
molecular_file_count_updated.py 3KB
backend_sanity_check.py 3KB
EventHandler.py 3KB
setup_slurm_specifications.py 3KB
Tokenizer.py 3KB
generate_images.py 3KB
sanity_check.py 3KB
reset.py 3KB
simple_job_predictions.py 2KB
auto_ssh.py 2KB
morgan_fp.py 2KB
jobid_writer.py 1KB
load_data.py 1KB
ProgressBar.py 1KB
util_functions.py 1KB
utils.py 869B
DDModelExceptions.py 706B
check_phase.py 601B
lasso_regularizer.py 538B
backend_exceptions.py 424B
__init__.py 183B
split_sdf.py 148B
__init__.py 124B
venv_sanity_check.py 114B
__init__.py 79B
__init__.py 77B
__init__.py 37B
__init__.py 1B
共 143 条
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PeterLee龍羿學長
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