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PARSEC - PAtteRn SEarch / Context:PARSEC - 模式搜索和情境化-开源
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2021-07-04
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基因组位点的表征是理解和利用下一代测序数据的主要挑战。 大多数基因组位点由具有分散分布的短简并基序表示,有时还具有生物学功能(例如:基因表达的调节、剪接模式或表观遗传学信号)。 这些基序与大量噪声相关,因此,用于准确检测基因组位点的计算平台的开发需要整合各种大规模生物数据以滤除误报。 PARSEC 代表了一种直观、模块化(易于扩展)和一体化的解决方案,用于有效集成大量不同的基因组信息,以便在用户友好的环境中对生物位点进行非线性定位和表征。 有关硬件要求和支持的浏览器,请参阅 wiki。
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