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SwitchSeq:从RNA序列数据中识别,注释和可视化剪接开关事件的工具
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2021-05-13
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SwitchSeq 处理RNA-seq数据时,存在几种工具可以量化跨条件剪接的差异并解决这些变化的重要性(例如 , )。 尽管这些工具通常很安静,但会产生一堆难以解释的基因。 通过依赖记录级别的量化,SwitchSeq提供了一种简单(至今功能强大)的方法来识别,注释和可视化跨两个不同条件(即切换事件)的拼接中的最极端变化。 简而言之,转换事件的定义是,对于给定的基因,最丰富的转录本的身份随条件而变化的情况: 借助SwitchSeq从RNA-seq实验中鉴定,剪接的极端变化的标记,注释和可视化。 MarGonzàlez-Porta,Alvis Brazma。 。 快速导航 执照 SwitchSeq已获得GPLv2许可。 接触 MarGonzàlez-Porta:
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SwitchSeq:从RNA序列数据中识别,注释和可视化剪接开关事件的工具 (103个子文件)
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