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电晕:逆向工程SARS-CoV-2
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2021-01-31
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对冠状病毒(SARS-CoV-2)进行反向工程 从这里开始: :thought_balloon: 背景 该项目运用来理解病毒。 此处的目的仅仅是从基本原理理解病毒。 生物学与软件 从根本上说,生物系统是。 虽然不是一个完美的类比,但软件为思考生物学提供了有用的框架。 下表提供了该类比的粗略概述。 :microscope: 生物学 :laptop_computer: 软件 笔记 3字节宽的指令集,带有任意“” 多蛋白是具有多个片段的功能 精度达80% 这似乎很难预测: : 10.1371/ 细菌是静态链接,病毒是动态链接 模拟 模拟似乎还行不通。 受工具和计算约束。 没有等效 我们正在对CAD格式进行逆向工程。 一次运行更像FPGA代码。 没有串行执行。 (什么是FPGA逆向工程工具?) :wrench: 进展 下载SARS-CoV-2基因组 是NIH遗传序列数据库,是所有公共可用DNA和RNA序列的带注释集合。 GenBank中可用的SARS-CoV-2序列已从download_sequences.py 。 将RNA转化为蛋白质 包含将RNA序列转换为链的功能tran
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樊康康
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