没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
panclassif:一种提高TCGA癌分类器性能的方法
共66个文件
py:29个
pyc:13个
gz:8个
需积分: 17 0 下载量 21 浏览量
2021-03-09
16:36:55
上传
评论
收藏 200KB ZIP 举报
温馨提示
PanClassif:用于癌癌分类的机器学习分类器管道 这是一个完整的机器学习管道软件包,可用于TCGA癌症RNA-seq基因计数数据。 数据预购 使用TCGA2STAT下载TCGA癌症和正常样本 使用knn-smoothing对上述收集的数据进行平滑处理( ) 功能 featSelect(homepath,cancerpath,normalpath,k) 参量 homepath:(str)您要保存所有生成的文件和文件夹的路径。 癌变路径:(str) 所有癌症的癌症基因表达矩阵所处的路径。 normalpath:(str) 所有癌症的正常基因表达矩阵所处的路径。 k:(int)每个癌症要选择的最重要基因的数量。 (默认值:k = 5)您不能将k设置为小于5 dataProcess(homepath,names,cancerpath,smoothed_cancer,smoothed
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
panclassif-main.zip (66个子文件)
panclassif-main
pyproject.toml 108B
panclassif
steptwo.py 1KB
stepthree.py 697B
gseapy.py 1KB
models.py 9KB
stepone.py 825B
featSelect.py 3KB
dataProcess.py 1KB
__pycache__
binarymerge.cpython-38.pyc 1KB
dataProcess.cpython-38.pyc 2KB
multimerge.cpython-38.pyc 2KB
models.cpython-38.pyc 6KB
__init__.cpython-38.pyc 2KB
stepthree.cpython-38.pyc 907B
featSelect.cpython-38.pyc 3KB
steptwo.cpython-38.pyc 1KB
stepfive.cpython-38.pyc 2KB
stepone.cpython-38.pyc 1007B
test_train_split.cpython-38.pyc 3KB
stepfour.cpython-38.pyc 2KB
upsampling_train_data.cpython-38.pyc 3KB
test_train_split.py 5KB
stepfive.py 2KB
__init__.py 2KB
upsampling_train_data.py 4KB
stepfour.py 1KB
multimerge.py 2KB
binarymerge.py 2KB
LICENSE 1KB
dist
panclassif-1.21.7-py3-none-any.whl 14KB
panclassif-1.11.5.tar.gz 6KB
panclassif-1.22.1-py3-none-any.whl 16KB
panclassif-1.21.5-py3-none-any.whl 14KB
panclassif-1.11.5-py3-none-any.whl 10KB
panclassif-1.11.3-py3-none-any.whl 10KB
panclassif-1.11.6.tar.gz 6KB
panclassif-1.11.6-py3-none-any.whl 10KB
panclassif-1.22.0-py3-none-any.whl 15KB
panclassif-1.21.5.tar.gz 8KB
panclassif-1.11.3.tar.gz 6KB
panclassif-1.11.7-py3-none-any.whl 10KB
panclassif-1.22.1.tar.gz 11KB
panclassif-1.11.7.tar.gz 6KB
panclassif-1.22.0.tar.gz 9KB
panclassif-1.21.7.tar.gz 8KB
panclassif.egg-info
PKG-INFO 5KB
requires.txt 80B
SOURCES.txt 550B
top_level.txt 11B
dependency_links.txt 1B
setup.py 1KB
README.md 3KB
build
lib
panclassif
steptwo.py 1KB
stepthree.py 697B
gseapy.py 1KB
models.py 9KB
stepone.py 825B
featSelect.py 3KB
dataProcess.py 1KB
test_train_split.py 5KB
stepfive.py 2KB
__init__.py 2KB
upsampling_train_data.py 4KB
stepfour.py 1KB
multimerge.py 2KB
binarymerge.py 2KB
共 66 条
- 1
资源评论
少女壮士
- 粉丝: 26
- 资源: 4660
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功