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fastq-pair:快速高效地匹配配对的末端fastq文件
共23个文件
c:5个
md:4个
fastq:4个
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2021-05-15
17:44:28
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快速配对 重写配对的末端fastq文件,以确保所有读取都具有配对并分离出单例。 这段代码做一件事:它需要两个fastq文件,并生成四个fastq文件。 是的,免费提供,使您拥有的fastq文件数量增加了一倍!! 通常,当您获得配对的末尾读取文件时,您将拥有两个文件,一个文件中的/ 1序列,另一个文件中的/ 2序列(或/ f和/ r或仅两个具有相同ID的读取)。 但是,通常在处理来自第三方来源(例如 )的文件时,每个文件中的读取次数会有所不同(因为某些读取无法通过质量检查)。 黑桃,bowtie2和其他工具损坏,因为它们要求配对的最终文件具有相同的读取次数。 该程序解决了该问题。 它按顺序重写这些文件,并在命令行上提供两个文件的匹配文件,然后将任何不匹配的单次读取放置在两个单独的文件中,每个原始文件一个。 此代码旨在快速且高效地存储内存,并且可与大型fastq文件一起使用。 它不会
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fastq-pair-master.zip (23个子文件)
fastq-pair-master
.travis.yml 99B
INSTALLATION.md 1KB
CITATION.md 2KB
main.c 3KB
fastq_pair.h 1KB
test
left.fastq 252KB
right.fastq 78KB
right.fastq.gz 24KB
right_R2.fastq 79KB
left_R1.fastq 255KB
left.fastq.gz 77KB
fastq_pair.c 9KB
LICENSE 1KB
CHANGES.md 192B
VERSION 4B
.gitignore 483B
is_gzipped.h 194B
CMakeLists.txt 244B
is_gzipped.c 459B
robstr.c 1KB
README.md 6KB
test_gzip.c 549B
robstr.h 640B
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yilinwang
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