tidytranscriptomics:tidy 转录组学的宣言、研讨会和教程

整洁转录组学的宣言、研讨会和教程。 所有这些都在进行中 整洁的转录组学宣言 本文档规定了tidybulk和tidysc所基于的 tidy 转录组学的原则。 这些原则符合。 使用易于理解、冗长、无行话和首字母缩略词的词汇。 如果英文词典不足以理解函数或变量名的基本含义，那是一个不好的迹象。 一个神秘的词汇会令人难以置信地减慢学习速度； 并且节省几个字符的成本通常比您想象的要大。 尽可能以原始形式呈现/可视化信息。 现代可视化工具（例如 ggplot）允许使用自定义比例来可视化数据。 例如，为了可视化 p 值，应用log10_reverse比例而不是将 p 值转换为负对数形式； 为了可视化（原始的、缩放的和/或调整的）转录本丰度（以读取计数的形式）使用log1p比例而不是转换其对数（或每百万计数）形式的数据。 尽可能避免创建临时变量，并始终避免变量更新。 以交互方式工作时，包含数据的变量