没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
Aflav_thesis_supp
共59个文件
pdf:29个
txt:13个
r:10个
需积分: 5 0 下载量 166 浏览量
2021-03-11
06:02:52
上传
评论
收藏 3.7MB ZIP 举报
温馨提示
黄颈鼠姬鼠的生态和种群遗传学。 该知识库包含以上标题论文的补充材料。 其中包括以下内容: 第2章 代码 denovo_map_parameter_optimisation.sh使用Stacks 2.3d的denovo_map.pl管道优化参数以对样本进行基因分型。 stacks_data_extraction.sh从Stacks 2.3d中提取相关指标以优化参数 denovo_pipeline.sh在优化的参数组合上运行denovo_map.pl,并准备用于谱系构建的数据 M.musculus_insilico_digestion_parallel_SbfI_MseI.R运行参考基因组的计算机限制性内切酶消化并输出各种图 M.musculus_insilico_digestion_parallel_SbfI_MseI.R运行参考基因组的计算机限制性内切酶消化并输出各种图 table
资源详情
资源评论
资源推荐
收起资源包目录
Aflav_thesis_supp-main.zip (59个子文件)
Aflav_thesis_supp-main
chapter3
tables_and_figs
allele_frequencies.txt 1.21MB
genetic_diversity.het 41KB
allele_frequency_change.txt 1.3MB
genealogical_genetic_contributions.txt 40KB
Pedigree.txt 23KB
pvals.txt 1.54MB
maybe_relatives.txt 51KB
code
allele_freq_sims
nullMAFsimulations.R 16KB
cluster
MAF_clusterRun.R 7KB
MAF_clusterRun_control.sh 2KB
extract_confint.R 3KB
nullMAFsimulations.sh 447B
pedigree_construction_R3.6.R 17KB
allele_frequency_change.R 20KB
genetic_contributions.R 13KB
README.md 4KB
chapter2
tables_and_figs
A.flavicollis_demographic_data.txt 39KB
adapter_primer_sequences.pdf 561KB
sample_groups.txt 2KB
genotyping_error_rates.txt 54KB
coverage_duplicates_merged.txt 53KB
relatedness_results_duplicatesMerged.txt 4.03MB
parameter_optimisation_metrics.txt 447KB
code
stacks_data_extraction.sh 9KB
denovo_pipeline.sh 11KB
M.musculus_insilico_digestion_parallel_SbfI_MseI.R 12KB
denovo_map_parameter_optimisation.sh 2KB
stacks_metrics.R 12KB
chapter4
tables_and_figs
heritability_diagnostic_plots
repeatability
mb_resid_vs_fitted_males_repeatability.pdf 14KB
mb_bmr_resid_vs_fitted_females_repeatability.pdf 11KB
qqplot_female_repeatability.pdf 16KB
sex_mb_residuals_vs_fitted_repeatability.pdf 19KB
qqplot_male_repeatability.pdf 29KB
mb_resid_vs_fitted_females_repeatability.pdf 9KB
mb_residuals_vs_fitted_repeatability.pdf 19KB
qqplot_repeatability.pdf 40KB
mb_bmr_resid_vs_fitted_males_repeatability.pdf 16KB
sex_mb_bmr_residuals_vs_fitted_repeatability.pdf 22KB
heritability
mb_females_residuals_vs_fitted_heritability.pdf 6KB
sex_mb_residuals_vs_fitted_heritability.pdf 9KB
mb_bmr_males_residuals_vs_fitted_heritability.pdf 8KB
qqplot_females_heritability.pdf 13KB
qqplot_heritability.pdf 16KB
qqplot_males_heritability.pdf 8KB
sex_mb_bmr_residuals_vs_fitted_heritability.pdf 10KB
mb_males_residuals_vs_fitted_heritability.pdf 8KB
mb_bmr_females_residuals_vs_fitted_heritability.pdf 6KB
mb_residuals_vs_fitted_heritability.pdf 9KB
cluster_analysis
k6.pdf 26KB
k5.pdf 26KB
k10.pdf 28KB
k3.pdf 25KB
k9.pdf 27KB
k8.pdf 27KB
cluster_indices.txt 449B
k7.pdf 27KB
k4.pdf 26KB
code
torpor_analysis_REML.R 28KB
cluster_analysis.R 11KB
共 59 条
- 1
weixin_42097189
- 粉丝: 38
- 资源: 4567
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功
评论0