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矩阵序列matlab代码-ripser:Ripser:Vietoris-Rips持久性条形码的高效计算
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2021-05-19
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矩阵序列matlab代码抢劫者 版权所有:copyright:2015–2021。 描述 Ripser是用于计算Vietoris-Rips持久性条形码的精益C ++代码。 它可以做这件事,但是做得非常好。 要观看Ripser功能的实时演示,请转到。 计算在浏览器内部进行(用于将Ripser编译为,在最近的浏览器中受支持)。 Ripser的主要功能: 节省时间和内存 一个C ++文件中只有大约1000行代码 支持素有限域中的系数 没有外部依赖项(对Google的[sparsehash]的可选支持) 目前,Ripser在计算时间上胜过其他代码(,,,,)超过40倍,而在存储效率方面则超过15倍(例如在处链接的示例)。 (请注意,其中不包含用于生成Vietoris-Rips过滤的代码)。 Ripser当前支持的输入格式: 逗号分隔值下三角距离矩阵 逗号分隔值的上三角距离矩阵(函数pdist MATLAB输出) 逗号分隔值全距离矩阵 距离矩阵数据 稀疏三元组格式的稀疏距离矩阵 二元下三角距离矩阵 点云数据 Ripser的效率基于一些重要的概念和原则,并基于其他研究人员在计算拓扑结构方面先前和同时进行的重要开发:
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ripser-master.zip (20个子文件)
ripser-master
.gitignore 44B
README.md 7KB
.gitmodules 118B
COPYING.txt 1KB
.clang-format 292B
examples
o3_2048.txt 356KB
rp2_600.lower_distance_matrix.csv 3.24MB
random20.lower_distance_matrix 651B
o3_4096.txt 712KB
projective_plane.csv 337B
projective_plane.lower_distance_matrix 156B
o3_8192.txt 1.39MB
pointsCycloOctane.csv 1.02MB
projective_plane.dipha 1KB
sphere_3_192.lower_distance_matrix 146KB
o3_1024.txt 178KB
random16.lower_distance_matrix 493B
robin-hood-hashing
ripser.cpp 43KB
CONTRIBUTING.txt 668B
Makefile 368B
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weixin_38741759
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