论文研究 - 番茄的遗传多样性和种群结构

植物育种计划中开发的遗传变异是创建新组合的基础，新组合可导致具有增强特性的品种。 多年以来，与德州农工大学系统相关的番茄（Solanum lycopersicum）育种计划已经开发出了番茄形态多样的品系，以耐热性，果实品质和抗病性为基础，使其适应德州的生长条件。 在这里，我们探索了322个栽培番茄基因型的种内遗传变异，包括三个德州A＆M育种计划开发的300个育种系，以此作为实施分子育种方法的第一步。 通过使用低覆盖全基因组测序（SkimGBS）进行测序进行基因分型，鉴定出10,236个高质量的单核苷酸多态性（SNP），用于评估遗传多样性，种群结构以及基因型与育种计划之间的系统发育关系。 基于模型的种群结构分析，系统树的构建和主成分分析表明，基因型分为两个主要簇。 遗传距离分析显示，这三个育种计划的产品之间具有更大的遗传多样性。 由Weslaco，College Station的Texas A＆M计划以及Paul Leeper博士开发的种质分别显示出0.175-0.434、0.099-0.392和0.183-0.347的遗传多样性范围，这表明品系内部和品系之间存在足够的变异从这三个程序中