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植物育种计划中开发的遗传变异是创建新组合的基础,新组合可导致具有增强特性的品种。 多年以来,与德州农工大学系统相关的番茄(Solanum lycopersicum)育种计划已经开发出了番茄形态多样的品系,以耐热性,果实品质和抗病性为基础,使其适应德州的生长条件。 在这里,我们探索了322个栽培番茄基因型的种内遗传变异,包括三个德州A&M育种计划开发的300个育种系,以此作为实施分子育种方法的第一步。 通过使用低覆盖全基因组测序(SkimGBS)进行测序进行基因分型,鉴定出10,236个高质量的单核苷酸多态性(SNP),用于评估遗传多样性,种群结构以及基因型与育种计划之间的系统发育关系。 基于模型的种群结构分析,系统树的构建和主成分分析表明,基因型分为两个主要簇。 遗传距离分析显示,这三个育种计划的产品之间具有更大的遗传多样性。 由Weslaco,College Station的Texas A&M计划以及Paul Leeper博士开发的种质分别显示出0.175-0.434、0.099-0.392和0.183-0.347的遗传多样性范围,这表明品系内部和品系之间存在足够的变异从这三个程序中
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