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论文研究 - 尼日利亚南部山药的遗传多样性和DNA条形码
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2020-05-23
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尼日利亚南部的埃努古州和埃博尼州缺乏对山药遗传多样性和条形码的知识。 因此,DNA条码用于促进尼日利亚南部山药种类的鉴定和生物多样性研究。 从Enugu和Ebonyi州(包括国际热带农业研究所)收集了75种山药,用于使用叶绿体DNA(cpDNA)核糖-1,5-双磷酸羧化酶(rbcL)标记进行DNA提取和扩增。 这些种质之间的高度相似性和534个保守位点和7个可变位点的存在。 鉴定出在共有位点335处的G / T的颠换突变,随后在这些种内的362(A / G),368(A / G),371(C / T)和391(C / T)的转变。 系统发育将山药种分为10个主要组,其自举值范围为0-100。系统发育多样性在X组中最高,其次是VII,VI和IX。 基于Kimura 2参数模型的群体间遗传距离范围为0.5000±0.4770-5.0560±2.5760,而群体内遗传距离为0.5250±0.5000-2.0103±1.2579。 整个种群的平均遗传多样性为0.7970±0.06910。 BLAST分析的总位得分,查询覆盖率和同一性百分比分别在411-1011、99%-100%和97%-1
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