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matlab中存档算法代码-FALCON:鹘
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2021-05-23
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matlab中存档算法代码###鹘### 磁通分配(带有)LAD凸物镜(和)归一化。 LAD或最小绝对偏差是最小二乘法的1范数等效项。 当前,实现了两种算法。 第一种算法估计酶复合物的丰度,然后将其输入第二种算法,该算法也将基因组规模的代谢模型作为输入。 第二种算法的输出是从中提取表达式和模型的环境的估计通量。 最新发布: 安装 ==== FALCON应该可以在所有主要平台(Windows,Linux,OS X)上运行。 此时,要求用户熟悉UNIX命令行并且具有安装UNIX软件的经验。 它可能也可以在其他平台上运行,但是某些MATLAB代码需要移植到GNU Octave。 原则上应该很简单。 必要先决条件 有几个基本先决条件: MATLAB :目前是运行磁通拟合算法和运行大多数分析所必需的。 这是唯一的非免费要求。 COBRA Toolbox :为分析基因组规模的代谢模型而开发的MATLAB软件包。 我们假设使用COBRA标准,并在我们的代码中使用了其许多功能。 有关文档和协议,请参阅。 我们已经使用了该项目的一个分支。 Boehm GC:尽管在Cygwin中,必须使用安装程序明确安装
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matlab中存档算法代码-FALCON:鹘 (319个子文件)
falcon_gmeanvar_dats.c 381KB
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minDisjNoCov_dats.c 193KB
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falcon_cnfize_ifnot_dats.c 77KB
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falcon_expvar_dats.c 11KB
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