论文研究 - 奶牛临床乳腺炎肠道真菌群落分析

临床乳腺炎（CM）是导致奶牛健康疾病的最常见原因之一。 在本文中，我们为CM母牛的肠道真菌群落提供了新见解。 我们从当地的奶牛场中选择了两只患有CM的母牛和四只健康的母牛。 我们将四头健康的母牛（H1，H2，H3，H4）分为对照组，将两头有CM的母牛（CM1，CM2）归为病例组。 高通量测序用于检测病例组和对照组之间的真菌群落差异。 在门和属水平都检测到肠道真菌群落的差异。 在对照组和病例组中检测到4个门和98个属。 在门的水平上，我们发现病例组中担子菌的相对丰度低于对照组。 在属水平上，与健康组相比，未分类的酵母菌和未分类的真菌的相对丰度均较高，而假单胞菌，毛孢菌，微孔雀菌，未分类的念珠菌和Scedosprium的相对丰度均较低。 总体来看，病例组肠道真菌群落的多样性和丰度均低于对照组。 总之，对照组和病例组之间的肠道真菌群落存在一些差异，本研究的见解可用于开发基于微生物群的CM诊断。