论文研究 - Y-SNP Z-381是法国皇家波旁王朝的父系DNA标记

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通过分子杂交实验对p49,f Taq I多态性进行了分子杂交实验,并对R-S21和Z381 Y-SNP标记进行了聚合酶链反应,分析了来自西欧的1100多名无关男性。 相应的两个SNP单倍群显示以比利时,荷兰,丹麦和德国北部为中心的相似的小群频率分布模式。 最后一位法国国王路易十六是Z381 +。 为法国波旁王朝家族的活后代波旁-帕尔马的Sixte-Henri亲王建立了完整的经过校正的Y-STRs资料; 对位于Z381下的其他Y-SNP标记的探索表明他属于DF98单倍群。

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论文研究 - Y-SNP Z-381是法国皇家波旁王朝的父系DNA标记

通过分子杂交实验对p49,f Taq I多态性进行了分子杂交实验,并对R-S21和Z381 Y-SNP标记进行了聚合酶链反应,分析了来自西欧的1100多名无关男性。 相应的两个SNP单倍群显示以比利时,荷兰,丹麦和德国北部为中心的相似的小群频率分布模式。 最后一位法国国王路易十六是Z381 +。 为法国波旁王朝家族的活后代波旁-帕尔马的Sixte-Henri亲王建立了完整的经过校正的Y-STRs资料; 对位于Z381下的其他Y-SNP标记的探索表明他属于DF98单倍群。

2020-05-23 立即下载
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论文研究-基于Relief和SVM-RFE的组合式SNP特征选择.pdf

针对SNP的全基因组关联分析面临SNP数据的高维小样本特性和遗传疾病病理的复杂性两大难点, 将特征选择引入SNP全基因组关联分析中, 提出基于Relief和SVM-RFE的组合式SNP特征选择方法。该方法包括两个阶段:Filter阶段, 使用Relief算法剔除无关SNPs; Wrapper阶段, 使用基于支持向量机的特征递归消减方法(SVM-RFE)筛选出与遗传疾病相关的关键SNPs。实验表明, 该方法具有明显优于单独使用SVM-RFE算法的性能, 优于单独使用Relief-SVM算法的分类准确率, 为SNP全基因组关联分析提供了一种有效途径。

2019-07-22 立即下载
756KB
论文研究-PCA与随机森林相结合筛选高信息量SNP位点——应用于羊的品种鉴别.pdf

针对品种鉴别中面临的SNP(Single Nucleotide Polymorphisms)数据高维小样本的难点,研究利用少数高信息量SNP位点正确鉴别品种的方法,提出了一种新的SNP位点筛选方法。先利用PCA提取SNP主要位点,随后使用随机森林方法,根据平均精度下降和Gini指数下降对主位点的重要性进行评估,训练分类模型。最后分别选取重要度排名前48和96的位点,以这些位点为分类特征,建立分类模型进行品种鉴别。将该模型应用于6种绵羊Illumina OvineSNP50的SNP数据。实验表明,可以从46 013个位点中分别筛选出49、96个高信息量位点用于品种鉴别,鉴别准确率达到97%以上。

2019-09-07 立即下载
2.58MB
论文研究 - 使用rhPCR和Universal Reporters的高性能且具有成本效益的SNP基因分型方法

我们已经开发了一种新型的双酶化学,称为rhAmp:registered:SNP基因分型,它基于RNase H2依赖性PCR(rhPCR),可为SNP分析提供高信号和特异性。 rhAmp SNP基因分型将独特的两种酶系统与3'末端封闭的DNA-RNA杂交引物结合在一起,以探询SNP位点。 封闭的引物的激活发生在与其完全匹配的靶标杂交后,从而消除或大大减少了引物二聚体。 热稳定的热启动RNase H2立即在核糖的5'处切割引物,释放封闭基团并允许引物延伸。 使用突变的Taq DNA聚合酶可进一步提高PCR特异性,从而改善等位基因的识别能力。 使用通用报告系统获得信号生成,该系统仅需要两个双等位基因

2020-05-25 立即下载
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论文研究 - 全基因组适应中单核苷酸多态性(SNP)生物学的数学建模

作为一种生活信息和通信系统,基因组以单核苷酸多态性(SNP)编码模式,反映了人类的适应性,从而优化了不同环境下的种群生存。 本文对环境诱导的适应力进行数学建模,以量化种群之间SNP频率分布的变化。 我们在生物物理方法(例如最小化基因组自由能)与种群遗传学概念之间建立直接联系。 我们无偏见的计算机程序扫描了主要组织相容性复杂区域中的一大批SNP,并标出了对SNP的高度依赖性,该SNP与对氧气剥夺的反应有关。 我们的双盲方法的统计能力在标记具有特定环境参数的多个人群中基于SNP信息的电位的数学函数相关性时得到证明。 此外,我们的方法为常见变异生物学的新发现提供了见识。 本文演示了种群多样性的生物物

2020-05-25 立即下载
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SNP-2611矿用综合保护测控装置说明书

SNP-2611矿用综合保护测控装置说明书 SNP-2611 系列网络型矿用隔爆开关微机监控保护装置,是上海南自科技股份有限公司根据 数字化矿井要求,总结国内外微机保护及控制的研究和生产先进经验,在公司先进微机技术的 基础上联合华中科技大学、中国矿业大学,研制出来的新一代微机保护监控装置。适用于 10kV、 6kV 和 3.3kV 电网中性点不接地供电系统或中性点欠补偿接地系统,是供、变电系统中电力开 关高级多功能综合保护装置,可对电网和设备起到监控和保护作用。同时,装置还具有通讯接 口,可与其他设备联网构成煤矿电网安全防控系统。能够把井下设备的电力参数,运行参数, 电量信息,设备状态以及电力

2018-08-16 立即下载
1.06MB
论文研究 - IL28B SNP rs12979860和rs8099917与阿根廷慢性HCV患者的炎症反应相关

背景:丙型肝炎病毒(HCV)是导致慢性肝病(包括肝硬化和肝癌)的主要原因。 我们研究的目的是确定IL28B单核苷酸多态性(SNP)rs12979860和rs8099917是否可被视为未治疗的慢性HCV患者的预后宿主因素。 方法:我们建立了实时等位基因特异性PCR扩增,以确定每个多态性位点中存在的等位基因,并进行统计学分组并将该结果与临床数据进行比较。 结果:我们在未经治疗的慢性HCV感染患者的单个队列中确定了rs12979860和rs8099917的基因型和等位基因频率。 我们发现,较高的炎症活动(以ALT水平或METAVIR分数衡量)与rs12979860 CC(分别为P = 0.0013和

2020-05-30 立即下载
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论文研究 - 协会COL1A1 rs180012 SNP和纤维肌痛表明胶原结构在肌肉骨骼疼痛中的影响。

纤维肌痛(FM)是一种复杂的慢性疾病,会引起广泛的肌肉骨骼疼痛,疲劳和多种其他症状。 已经研究了许多与神经内分泌系统有关的多态性,如ApoE亚型,COMT中的Val158Met多态性以及位于5-HTTLPR的44 bp缺失。 其他多态性也与炎症反应有关,例如IL-4中的70 bp VNTR或胞嘧啶水平。 此外,已经通过全基因组关联扫描(GWAS)进行了一些致力于发现新的FM相关SNP的研究。 这项工作的目标是研究影响骨骼矿化的I型胶原多态性(COL1A1 rs180012 SNP)与纤维肌痛的可能联系。 获得的结果表明,ss纯合子基因型与FM患者明显相关,而与骨矿化无关。

2020-05-30 立即下载
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论文研究-基于多元方差分析的成对肿瘤SNP array数据分段算法 .pdf

基于多元方差分析的成对肿瘤SNP array数据分段算法,习佳宁,刘元宁,单核苷酸多态性微阵列(SNP array)技术是近年来获得快速发展的一种高通量生物芯片技术,可以有效地对肿瘤细胞中的染色体变异进行检

2019-08-16 立即下载
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微测序技术检测12个Y-SNP及其群体遗传学研究

微测序技术检测12个Y-SNP及其群体遗传学研究,杜宏,张林,目的 应用SNaPshot Kit对Y染色体上12个SNP位点进行快速而准确的检测,对四川地区78个汉族男性无关个体进行群体遗传学研究, 并对性犯罪案�

2020-03-05 立即下载
587KB
论文研究-,.pdf

对区间数目参数化分段线性混沌映射(SNP-PLCM)的密码学特性进行详细分析,并以此为基础,提出了一种基于区间数目参数化分段线性混沌映射的伪随机序列发生器。该发生器同时利用控制参数扰动策略和输出序列扰动策略避免数字化混沌系统的动力学特性退化。理论分析和仿真实验结果表明,该算法产生的伪随机序列具有理想的性能。

2019-09-12 立即下载
1.39MB
论文研究 - 使用来自两个重组自交水稻品系的基于SNP的连锁图谱鉴定抗稻瘟病,白叶枯病和飞虱抗性的QTL

稻米是全球最重要的粮食安全。 几种生物因素限制了水稻的生产,因此,育种抗生物大米已成为越来越重要的目标。 两个优良水稻系IR71033-121-15(IR71033)和IR57514-PMI-5-B-1-2(IR57514)提供了生物抗逆性状的潜在基因。 在这项研究中,基于单核苷酸多态性(SNP)的连锁图构建通过测序(GBS)进行基因型分型被用于检测稻瘟病(BL),细菌疫病(BB),白背飞虱(WBPH)的数量性状基因座(QTL),和褐飞虱(BPH)抗性。 IR71033源自Oryza minuta,并带有BL,BB,WBPH和BPH抗性QTL。 IR57514是一种适应性强的雨养低地线路,带有

2020-05-21 立即下载
381KB
论文研究 - 慢性肾脏病高尿酸血症患者的URAT1(rs7932775)和ABCG2(rs3825016)的单核苷酸多态性(SNP)

背景:越来越多的慢性肾脏病(CKD)患者伴有高尿酸血症。 众所周知,高尿酸血症是心血管疾病(CVD)和慢性肾脏疾病的独立危害。 我们旨在确定患有高尿酸血症和/或痛风的CKD患者的hURAT1(rs7932775)和ABCG2(rs3825016)的单核苷酸多态性(SNP)差异。 方法:将42例CKD患者分为两组:高尿酸血症和对照组。 准备24小时尿液样品和血清以测试生化参数。 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法用于分析不同组中的hURAT1和ABCG2单核苷酸多态性。 结果:高尿酸血症组有17例hURAT1的CT SNP(rs7932775)和13例ABCG2的CT S

2020-05-26 立即下载
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论文研究 - RNA-Seq和散装分离基因分析与高生长的相关基因

银杏的寿命很长,其生长相对较慢。 但是,对该物种中与生长相关的基因知之甚少。 我们通过在转录组水平上开发多态性分子标记,将mRNA测序(RNA-Seq)与大量分离子分析(BSA)结合起来,精细绘制重要的农艺性状基因。 在这项研究中,对银杏半同胞家族的高生长(GD)和低生长(BD)样品进行了转录组测序。 组装干净的读段后,检测到601个差异表达基因,其中513个被分配了功能注释。 单核苷酸多态性(SNP)分析鉴定出与GD和BD组中的119个基因相关的SNP; 这些基因中有58个带有注释。 与BD组相比,GD组中两个Homeobox-亮氨酸拉链蛋白基因上调。 因此,这些很可能与银杏的高生长有关。

2020-05-23 立即下载
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论文研究 - 的遗传变异

背景:hTERT是端粒生物学的关键参与者,其活性与细胞衰老以及许多健康相关问题(包括癌症)的发展直接相关。 尽管以前的研究调查了这种关联,但结果在人群之间差异很大。 这项研究旨在调查埃及女性中hTERT基因SNP与乳腺癌(BC)的风险及其对端粒长度(TL)的影响。 方法:采用PCR-RFLP技术对218例BC患者和178例年龄相匹配的健康女性进行hTERT变体rs2736098G> A,rs2735940C> T基因分型,并通过PCR对MNS16A串联重复进行基因分型,以确定其与乳腺癌风险的相关性。 使用qPCR测量端粒长度。 结果:hTERT rs2736098G>结果表明AG和GG基因型以

2020-05-21 立即下载
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论文研究 - Tetra引物ARMS PCR优化检测单核苷酸多态性

GWAS(全基因组关联研究)已将2型糖尿病与KLF14基因的单核苷酸多态性(SNP)rs972283(A / G)相关联。 用于分析SNP的最常用技术是耗时的多步骤过程,并且需要昂贵的仪器。 因此,为了克服这些问题,我们针对基因型rs972283开发了一种新型,快速且经济高效的T-ARMS PCR检测方法。 然而,优化步骤可能是艰苦而费力的。 因此,我们建议以提供有用信息的方式来演示和讨论其开发的关键步骤。 在第一步中,我们设计并验证了用于T-ARMS PCR的两个特定引物对。 随后,针对DNA浓度,退火温度,Taq DNA聚合酶单位和引物浓度优化了扩增条件。 最后一个被认为是正确放大和适当频

2020-05-31 立即下载
659KB
论文研究-单体型组装MEC问题的参数化算法研究.pdf

单体型组装MEC问题指如何利用个体的DNA测序片断数据,翻转最少的SNP位点值以确定该个体单体型的计算问题。根据片段数据的特点提出了一个时间复杂度为 O(nk22k2 mlogm mk1)的参数化算法,其中m为片段数,n为单体型的SNP位点数,k1为一个片断覆盖的最大SNP位点数(通常小于10),k2为覆盖同一SNP位点的片段的最大数(通常不大于10)。对于实际DNA测序中的片段数据,即使m和n都相当大,该算法也可以在较短的时间得到MEC问题的精确解,具有良好的可扩展性和较高的实用价值。

2019-09-11 立即下载
361KB
论文研究 - 氦等离子序列最强X射线线用于等离子体诊断

我们报告了三个最强线的准确波长(共振线:1s2 1S0-1s2p 1P1,组合线:1s2 1S0-1s2p 3P1和禁止线:1s2 1S0-1s2s 3S1)以及1s2 1S0-1snp1P1和1S0的波长在类似He的系统(Z = 2 – 13)中1snp3P2(2≤n≤25)跃迁。 属于上述跃迁的第一条谱线是在“每单位核电荷筛选常数”方法的框架内建立的。 获得的结果与各种实验和理论文献数据非常吻合。 当前计算与可用文献数据之间的波长不确定度小于0.004Å。 本文中列出的许多新数据可能对天体物理学和实验室血浆诊断感兴趣。

2020-05-14 立即下载
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论文研究 - 孟加拉国吉尔伯特综合征的患病率

背景:吉尔伯特综合症(GS)的特征是由于尿苷二磷酸葡萄糖醛酸糖基转移酶(UGT1A1)基因的多态性导致血清bil-irubin升高。 多项研究发现,吉尔伯特综合症在某些亚洲国家中患病率很高,但在孟加拉国仍未进行研究。 这项研究的目的是确定孟加拉国人口中UGT1A1多态性的两个不同变异(UGT1A1 6和UGT1A1 28)的等位基因频率。 资料和方法:共有150名来自中央医院有限公司的外展部门和达卡的Bangabandhu Sheikh Mujib医科大学的无关志愿者参加了这项研究。 从每个受试者获得外周血,并通过基因组DNA分离试剂盒进行DNA提取。 使用TaqMan按需分析SNP分型系统对

2020-05-29 立即下载
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论文研究 - 使用生物信息学工具测试衰老的突变累积理论

目的:许多变异机制的相互作用被认为是衰老或衰老的基础。 突变积累理论提出蛋白质中突变的积累,以引起其衰老表型。 从未测试过随机突变是否会导致衰老表型,并且认为这是不可行的。 生物信息学算法提供了一种先验的方法,可以进行测试; 他们利用经过充分研究的蛋白质的先验知识来预测突变带来的变化。 在这里,使用这种生物信息学工具测试了衰老的突变积累理论。 方法:这是一项模拟研究,于2017年9月进行,使用具有Web可访问性的算法。 选择了三种与衰老有关的经过充分研究的蛋白:胶原蛋白,β-淀粉样前体蛋白(β-APP)和低密度脂蛋白受体(LDL-受体)。 将随机突变引入其天然编码序列。 然后,使用三种不同的预

2020-05-29 立即下载
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