没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
matlab代码影响-Lolipop:穆勒图擅长可视化种群随时间的演化动态。常见用例以及开发过程中的预期用例描述了群体中基因型的...
共253个文件
py:104个
png:39个
tsv:26个
需积分: 10 1 下载量 97 浏览量
2021-05-22
08:21:14
上传
评论
收藏 18.53MB ZIP 举报
温馨提示
matlab代码影响一组脚本,通过背景将突变轨迹聚类为基因型和聚类基因型 内容 安装 这些脚本可在上使用,并可以与以下脚本一起安装 pip install lolipop 要将脚本更新到最新版本,只需运行 pip install lolipop --upgrade 然后使用运行脚本 lolipop lineage [args] 尽管可能需要单独安装其他必需的软件包,但也可以简单地克隆该软件包。 git clone https://github.com/cdeitrick/lolipop.git cd lolipop lolipop lineage [args] 要求 这些脚本需要一些python软件包才能工作。 其中每一个都可以使用pip install [package]或conda install [package] 。 数据类(如果使用低于3.7的python版本) 洛古鲁 matplotlib 大熊猫 pygraphviz 科学的 海生的 xlrd(读取Excel文件) 如果pygraphviz软件包在安装过程中引发错误,通常是因为它在当前环境中找不到正确的依赖项。 使用安装依
资源详情
资源评论
资源推荐
收起资源包目录
matlab代码影响-Lolipop:穆勒图擅长可视化种群随时间的演化动态。常见用例以及开发过程中的预期用例描述了群体中基因型的丰富度和继承性 (253个子文件)
example.muller.csv 21KB
.directory 81B
.directory 49B
lineage.lineagescript.png.dot 2KB
lineage.lineagescript.svg.dot 2KB
lineage.lineagescript.svg.dot 2KB
lineage.lineagescript.png.dot 2KB
.gitignore 915B
tox.ini 517B
example.json 1017B
options.json 959B
options.json 959B
LICENSE 1KB
lolipop 2KB
manual.md 38KB
README.md 23KB
clustering_methods.md 14KB
usage.md 8KB
preparing_input_data.md 7KB
nesting.md 5KB
overview.md 2KB
future_changes.md 1KB
filters.md 1KB
example.mermaid.md 783B
user_manual.pdf 354KB
clustering.pdf 337KB
nesting.pdf 129KB
overview.pdf 46KB
filters.pdf 40KB
example.muller.annotated.pdf 17KB
binomial_probability.pdf 15KB
example.genotypes.filtered.png 765KB
example.genotypes.distinctive.png 549KB
lineage.timeseriespanel.png 514KB
lineage.timeseriespanel.png 508KB
lineage.lineagepanel.png 504KB
lineage.lineagepanel.png 499KB
dendrogram.png 466KB
example.heatmap.distance.png 395KB
example.dendrogram.png 378KB
lineage.muller.annotated.png 364KB
lineage.muller.annotated.png 364KB
example.muller.basic.png 330KB
lineage.timeseries.genotypes.png 327KB
lineage.timeseries.genotypes.png 323KB
lineage.muller.unannotated.png 303KB
lineage.muller.unannotated.png 297KB
2-filter_genotypes.png 271KB
1.3-unlink_genotypes.png 248KB
B1_twostep_trajectories.png 240KB
B1.twostep.trajectories.edited2.png 240KB
B1.twostep.trajectories.png 238KB
4-nest_genotypes.png 234KB
B1.hierarchy.binomial.trajectories.png 231KB
example.trajectories.distinctive.png 231KB
B1.twostep.trajectories.edited.png 217KB
lineage.mullerpanel.png 213KB
lineage.mullerpanel.png 209KB
heatmap.png 157KB
example.muller.unannotated.png 157KB
example.muller.annotated.png 156KB
lineage.lineageplot.png 90KB
lineage.lineageplot.png 85KB
3-sort_genotypes.png 68KB
example.geneology.distinctive.png 42KB
distancedistribution.png 42KB
1.2-group_genotypes.png 41KB
example.geneology.png 40KB
1-calculate_genotypes.png 38KB
0-overview.png 18KB
muller_plot.py 20KB
workflow_full.py 19KB
commandline_parser.py 18KB
mullerformat.py 17KB
scoring.py 17KB
test_muller_format.py 15KB
distance_calculator.py 14KB
widgets.py 12KB
filters.py 11KB
test_widgets.py 10KB
import_timeseries.py 9KB
test_lineage_models.py 9KB
panels.py 9KB
generate_genotypes.py 9KB
projectpaths.py 8KB
workflow_ggmuller.py 8KB
areascore.py 7KB
genotype_reorder.py 6KB
generate_tables.py 6KB
hierarchy.py 6KB
plottimeseries.py 6KB
clustercalc.py 6KB
polygon.py 6KB
genotype_ancestry.py 5KB
test_genotype_filters.py 5KB
projectdata.py 5KB
test_workflow_ggmuller.py 5KB
annotations.py 5KB
distance_methods.py 4KB
test_polygon.py 4KB
共 253 条
- 1
- 2
- 3
weixin_38600017
- 粉丝: 3
- 资源: 969
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功
评论0