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matlabcplex代码-move:MoVE是一种识别代谢阀门以从生长阶段切换到生产阶段的工具
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2021-06-02
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matlab cplex代码移动 MoVE 是一种识别代谢阀门以从生长阶段切换到生产阶段的工具。 它利用受约束的最小割集。 相关研究文章:Venayak, N.、von Kamp, A.、Klamt, S. 等。 MoVE 识别代谢阀以在表型状态之间切换。 Nat Commun 9, 5332 (2018)。 设置 CellNetAnalyzer 需要添加到 java 和 matlab 路径才能运行。 首先,在脚本 CNAPATH\startcna.m(CNAPATH 是您的 CNA 代码所在的目录)中,需要相应地设置以下两个变量: cplex_matlab_path = 'CPLEXROOT\cplex\matlab\OS'; % CPLEXROOT 是你安装 cplex 的目录,操作系统因你的电脑版本而异 cplex_jar_file= 'CPLEXROOT\cplex\lib\cplex.jar'; 无论何时启动 matlab,都必须运行 startcna.m 脚本。 它也作为 MoVE_startup.m 脚本的一部分运行。 其次,您必须将 cplex 共享库添加到 java.
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move-master.zip (13个子文件)
move-master
MoVE_startup.m 481B
MoVE
models
iJO1366_extras.mat 419KB
ecoli_core.mat 9KB
target_reactions.mat 801B
iJO1366.mat 196KB
runscripts
MoVE_demo_script_ec_core.m 2KB
MoVE_demo_script_ec_iJO.m 2KB
src
Orthogonal_cMCSEnumerator.m 3KB
validate_mcs2.m 3KB
calc_MoVE.m 24KB
add_subset_names.m 353B
requirements.txt 168B
README.md 2KB
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