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tif转rawmatlab代码-CaMKII-single-molecule:CaMKII单分子
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2021-05-27
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tif转原始Matlab代码CaMKII单分子 自述文件,用于Matlab代码和分析 在您选择的文件夹中获取所有.tif格式的原始图像文件。 使用ImageJ中的虚拟堆栈生成成对的合成图像(488:560通道或488:640通道)。 使用代码CAMKII_ImageJ_Preprocessing_Duplication_v2_TwoChannel_WOBlank.m来重建重复图像,以便在ImageJ的TrackMate模块中进行跟踪(有关详细信息,请查看代码注释)。 这些应写出文件Tirf488.tif(用于488通道)和Tirf560.tif(用于560通道)。 请注意,如果您有488:640复合对,则输出文件仍称为Tirf488.tif和Tirf560.tif,其中Tirf560.tif表示640通道的数据。 使用ImageJ中的单个粒子跟踪插件TrackMate通过分析这些文件(Tirf488.tif和Tirf560.tif)来检测单个单个粒子(Jaqaman等人,2008)。 这些将为每个单个粒子生成点和跟踪统计信息,并以.csv文件的形式写出。 将频道名称附加到这些.csv中
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CaMKII-single-molecule-master.zip (14个子文件)
CaMKII-single-molecule-master
find_coloc_plot_intensity.m 4KB
Spots in tracks statistics560.csv 9.47MB
getChannelData.m 2KB
Spots in tracks statistics488.csv 9.77MB
getIntensities.m 565B
LICENSE 1KB
readtext.m 20KB
README.md 1KB
Track statistics560.csv 4.24MB
CAMKII_ImageJ_Pretreatment_Duplication_v2_TwoChannel_WOBlank.m 2KB
findColocalization.m 5KB
plotIntensities.m 505B
getColocalizationCounts.m 466B
Track statistics488.csv 4.28MB
共 14 条
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