整合的转录组分析揭示了喉鳞状细胞癌中的miRNA-mRNA串扰

所需积分/C币:15 2021-03-03 20:43:19 640KB PDF
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事实证明,下一代测序(NGS)是描绘多种癌症分子亚型的强大工具,并且可以揭示整个癌症进展过程中基因组突变的积累。 使用深度测序技术从喉鳞状细胞癌(LSCC)患者获得全基因组microRNA(miRNA)和mRNA表达谱,并通过综合计算方法进行分析。 大量蛋白质编码和非编码基因被检测到差异表达,表明LSCC细胞中的功能转换。 总共检测到127个突变基因与外胚层和表皮发育显着相关。 发现有11种miRNA差异表达,其中包括潜在的癌症抑制miRNA mir-34c,其表达明显下调。 对mRNA和miRNA转录组的综合分析进一步揭示了11个miRNA和138个靶向基因之间的相关动力学,从而形成了对LSCC发育的高度动态的共调节网络响应。

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