没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
matlab求平均值的代码男-DTI:SBDTI管道
共61个文件
txt:7个
sh:6个
r:5个
需积分: 10 0 下载量 62 浏览量
2021-06-16
08:47:29
上传
评论
收藏 43KB ZIP 举报
温馨提示
matlab求求的代码男贸工部 SB DTI 管道 预处理 创建 DTI 文件夹并将 dicoms 转换为 NIfti # use foreach n (SB002_fu2 SB018_fu2 SB019_fu2…) from line 3 of subjects (all subjects) cd /danl/SB/ ${n} /anatomical/PING_30DIR_LONGTR_4/ if ( ! -d DTI) then mkdir DTI/ dcm2nii -o ./DTI -r N DICOM for i in $( ls ) ; do dcm2nii -p y -f y ${i} / * ; done ; 大脑提取 - 提取 b0 创建掩码 fslroi * .nii.gz ${n} _b0_AP 0 1 bet ${n} _b0_AP ${n} _brain -m -f 0.3 # cannot run topup becuase only 1 b0 image 运行涡流 # IF not running on cluster - I did not do thi
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
DTI-master.zip (61个子文件)
DTI-master
scripts
motion_assess
longDataSubjectList_ALL.txt 3KB
extractingOutlierData.R 1KB
extractingVolTransRotData.R 1KB
extractingRMS.R 1KB
autoptx
1.1extractAllValues.sh 13KB
autoPtx_prepareForDisplay_updatedScript 6KB
tbss_scripts
7.thresholding_randomise.sh 12KB
8.extractingLocationInfo.R 706B
makingCovariateFiles01.28.2019.Rmd 6KB
tbssVisualizationLongitudinal.Rmd 847B
tractography 655B
preproc
tractList.txt 36B
subjectList 2KB
subjectList.txt 2KB
eddy 376B
habanero
6.1randomise_cross 332B
0.1prepare_tbss_folder 710B
0.2prepare_bedpostx_folder 1KB
6.1b_randomise_cross_AD 332B
2.1tbss_2_reg 215B
0.3prepare_autoptx_folders 619B
6.2b_randomise_cross_Interaction_AD 350B
1.3autoPtx_1 294B
6.2randomise_cross_Interaction 348B
6.2b_randomise_cross_Interaction_MD 350B
6.2b_randomise_cross_Interaction_RD 350B
6.1b_randomise_cross_MD 335B
2.3autoPtx_2 208B
4.1tbss_4_prestats 203B
5.1b_tbss_non_FA_long 235B
0.1b_prepare_tbss_folders_nonFA_long 2KB
3.2registration_BEDPOSTX_eddy 9KB
6.1b_randomise_cross_RD 332B
1.1tbss_1_preproc 224B
5.1tbss_non_FA 230B
0.1perpare_tbss_folders_long 722B
1.1b_tbss_1_preproc_long 203B
0.1b_prepare_tbss_folders_nonFA 2KB
3.1tbss_3_postreg 201B
2.1b_tbss_2_reg_long 195B
2.2registration_prep 2KB
4.2probtrackxAmygSeed 2KB
5.2combineRD 341B
4.1b_tbss_4_prestats_long 192B
0.0eddy_opemp_batch.sh 456B
1.2bedpostx.sh 197B
3.1b_tbss_3_postreg_long 202B
mastersDTI.Rproj 205B
tractList.txt 36B
6.1extractAllValues.sh 11KB
README.md 17KB
7.thresholding_randomise.sh 12KB
subjects 11KB
subjectList.txt 2KB
6.2randomise.cross_Interaction 347B
Convert_to_NIFTI 419B
subjectListLong.txt 2KB
.gitignore 40B
6.2extractingAllValues.R 5KB
subjectListCross.txt 1KB
Seed_based_tractography 605B
共 61 条
- 1
资源评论
weixin_38529123
- 粉丝: 3
- 资源: 930
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功