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blast.fasta
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2022-11-26
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313B
FASTA
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blast.fasta
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parsing_blast_result.pl
/home/chenlianfu/chenlianfu_scripts/parsing_blast_result.pl [options] blast.out > blast.tab 对BLAST的xml或tab格式的结果进行解析和过滤，得到更准确的BLAST结果。结果为表格形式（BLAST outfmt6），结果按...
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blastjs:Node.js的BLAST +包装器
blast.js Node.js的BLAST +包装器可以...var fileIn = './test.fasta' ;var outPath = './' ;var name = 'example' ;blast . makeDB ( type , fileIn , outPath , name , function ( err ) { if ( err ) { console . er
blast2dem.zip_图形图像处理_Python_
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StampedeBLAST:在本地文件系统上运行 BLAST
踩踏爆炸 在本地文件系统上运行 BLAST：XSEDE-Stampede 使用此方法在 Stampede 的本地文件系统上运行BLAST... fasta-splitter.pl --n-parts 10 --measure count input.fasta 现在，有 10 个文件名： input.0 , input.1
KimBlast:爆炸+简单方法-开源
KimBlast GUI格式并为Blast索引Fasta数据库，执行Blast搜索并分析结果。 Python 3.x版本。 有关更多信息，您可以查看源代码树中的README.md文件：...
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Quick Primer-BLAST-crx插件
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blast.pl 陈连福的生物信息分析Perl程序
/home/chenlianfu/chenlianfu_scripts/blast.pl [options] BLAST_DB file.fasta > out.txt --tmp-prefix <string> default: blast 设置临时文件或文件夹前缀。默认设置下，程序生成command.blast.list，blast....
blastplus-parsing:解析爆炸报告的分类组成
自述文件 来自 BLAST 2.2.28+ 及更高版本的顶部爆炸命中的琐碎、快速和肮脏的水平条形图。...blastx -query query.fasta -db refseq_protein -max_target_seqs 1 -outfmt " 6 qseqid sseqid pident length
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PSI-BLAST：PSI-BLAST.ipynb脚本基于作为查询的arCOG和作为数据库的asgard_proteomes.fasta执行PSI-BLAST搜索。 neighborhood_analysis：hit_neighborhoods.ipynb脚本检索与每个匹配相邻的区域。 结果分析：Result_...
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脚本要求：a）具有contigs序列的Fasta文件b）HPVdatabase c）核苷酸-核苷酸BLAST 2.10.1+您会找到数据库所需的所有文件（2020年11月17日更新），但是，您可以自己创建它使用以下命令：makeblastdb -in HPV_COMPLETE...
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PolarProtPred 从氨基酸序列预测根尖/基底...从SP fasta文件构建blast数据库 从UniProt下载speindex.txt 用法 python3 Main.py <FASTA> <TOPOLOGY> <DISORDERED> <LOW> <OUTPUT> FASTA Input sequence file,
biopython中文文档
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丹的实验室笔记本2021-03-15_Siderastrea和Porites astreoides BlastAnnotation 下载新数据库####Sprot[dbarshis@coreV2-22-007 databases]$ pwd/cm/shared/apps/blast/databases[dbarshis@coreV2-22-007 ...wget ...
CompBio_miniproject
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从NCBI检索到的序列数据，可通过NCBI的BLASTN / BLAST +找到。 激发这项研究的论文： : 非常感谢Matthew Jones-Rhoades博士和Ole Foresberg博士。 用于从序列中构造这些数据的程序是Noisefinder程序。 您可以在...
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青年奥委会 YOC 是专为共线基因组设计的全基因组比对工具。 它由 Raluca Uricaru (LIRMM/LaBRI) 开发。 用法 要运行的主要脚本是runYOC.csh ，它需要： 第一个以 fasta 格式进行比较的...编译翻译器： make yass_blast
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输入：-序列数据库搜索：BLAST，FASTA套件。 -多序列比对：CLUSTAL，HSSP，MSF，FASTA，PIR，MAF。 输出：-HTML，FASTA，CLUSTAL，MSF，PIR，RDB（制表符分隔）。 发现了错误？ 请通过以下网址在MView问题跟踪器上...
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