1、MIMIC-II 数据库及其使用
1.1 MIMIC-II 简介
MIMIC-II(http://mimic.physionet.org/)是一个对公众免费开放的重症监护病人数据库,
收集了 2001 至 2008 年间来自 BIDMC 医学中心的 ICU 病人数据,目的是为了发展和评价先
进的 ICU 病人监护系统,以提高 ICU 临床决策支持的有效性、准确性和时效性。该数据库
包含临床数据库(clinical database)和生理波形数据库(physiological waveform database)两大部
分。临床数据库目前已经收集了超过 4 万例 ICU 病人的临床信息,包括病人人口统计特征、
检验检查结果、基本体征记录、输液和医疗干预记录、护理记录、影像学检查结果以及出院
记录等,每个记录都有详细的时间信息;生理波形数据库记录了来自飞利浦床旁监护仪的高
分辨率波形数据如心电、血压、脉搏波以及其他生理参数如呼吸、血氧、中心静脉压等等。
所有这些数据资源经过严格的去除身份信息处理。对全球研究人员免费开放,可以通过生理
数据资源网站 PhysioNet(http://www.physionet.org/)访问。
【王剑, 张政波, 王卫东,等. 基于
重症监护数据库 MIMIC-Ⅱ的临床数据挖掘研究[J]. 中国医疗器械杂志, 2014, 38(6):402-406.】
其中,MIMIC II 波形数据库(The MIMIC II Waveform Database)包含数以千计从床边
病人监测器收集的成人和新生儿重症监护室(ICU)信息,了波形形式的生理信号和数字形
式的生命体征时间序列。(MIMIC II 临床数据库则包含了波形数据库中许多患者的详细临
床信息)。记录的波形和数字信息根据 ICU 工作人员的选择而有所不同。但一般来说,波
形几乎都包括一个或多个心电(ECG)信号,连续动脉血压(ABP)波形,指尖光电容积脉
搏(PPG)信号,呼吸信号等至多 8 个同时序的信号。 数字通常包括心率、呼吸速率、血
氧饱和度(SpO2)、收缩压、平均值、舒张压,以及其他可用的信息。记录长度也不同,
从几个星期到几天,甚至几个小时。
【Goldberger AL, Amaral LAN, Glass L, Hausdorff JM, Ivanov
PCh, Mark RG, Mietus JE, Moody GB, Peng C-K, Stanley HE. PhysioBank, PhysioToolkit, and
PhysioNet: Components of a New Research Resource for Complex Physiologic Signals. Circulation
101(23):e215-e220 [Circulation Electronic Pages; http://circ.ahajournals.
org/cgi/Cont-ent/full/101/23/e215]; 2000 (June 13). 】【https://physionet.org/
physiobank/database/mimic2wdb/】
1.2 MIMIC-II 使用(多参数数据库文件识读)
MIMIC 数据库的数据文档对同步采集的生物电信号、血流动力学信号及其它各项生理
参数进行了记录,精心选择所监护对象, 每一次监护记录时间都超过几十个小时, 真实地反
映了病人生理状况的变化。数据库记录的存储有多种格式,可以实现两个或多个信号的样本
交替存储,其中“Format 212”、“Format 16”较为常用。【https://www.physionet.org/
Physiotools/wag/signal-5.htm】记录的内容包括头文件、数据文件、标记文件等文件。数据文
件对于变异性较大的生理参数采用连续采样的方式,对于相对稳定的生理参数采用周期采样
的方式。
1.2.1 头文件的识读(*.hea 文件)