扩散MRI：Jupyter笔记本用于分析扩散MRI数据，以便计算DTI，DKI，NODDI，SS3T-CSD和MSMT-CSD建...

扩散MRI（dMRI） 这些Jupyter笔记本包括弥散MRI数据分析以计算弥散张量成像（DTI） ，弥散峰度成像（DKI） ，神经突取向弥散和密度成像（NODDI） ，单壳3组织约束球面反褶积（SS3T-CSD）以及多壳多组织约束球面反褶积（MSMT-CSD）模型化参数图。 Jupyter笔记本电脑的预处理包括使用DIPY进行数据去噪，使用FSL TOPUP进行磁化率引起的畸变校正以及使用FSL EDDY进行涡流引起的畸变和运动校正。 注意：DKI，NODDI和MSMT-CSD建模参数图的估计需要至少两个b值（例如1000、2000）获得的扩散加权MRI数据。 依存关系 使用这些Jupyter笔记本的依赖项为： DIPY（ ） Nipype（ ） FSL（ ） AMICO（ ） MRtrix3（ ） 引文 Messinger，A.，Sirmpilatze，N.，