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TCGA临床数据提取
TCGA临床数据提取
TCGA
临床信息
生存分析
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自己编写程序,对TCGA的临床信息进行整理和提取,便于做生存分析
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TCGA临床数据提取_perl提取tcga临床数据,perl读取临床数据报错
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5星 · 资源好评率100%
自己编写程序,对TCGA的临床信息进行整理和提取,便于做生存分析
TCGA-BRCA-mRNA表达数据——乳腺癌表达及临床数据集整理
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5星 · 资源好评率100%
TCGA-BRCA数据集已经整理成LCPM格式,临床数据已经汇总整理。 LCPM格式即log2(CPM+1)格式,现在认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式比较过时了。部分生信文章审稿人推荐使用此格式分析数据
TCGA-KIRC-mRNA表达数据——肾透明细胞癌表达及临床数据集整理
浏览:62
5星 · 资源好评率100%
TCGA-KIRC数据集已经整理成LCPM格式,临床数据已经汇总整理。 LCPM格式即log2(CPM+1)格式,现在认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式比较过时了。部分生信文章审稿人推荐使用此格式分析数据
TCGA数据下载及全流程分析(更新中)
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5星 · 资源好评率100%
一、GDCRNATools包下载 首先下载R包 if (!requireNamespace(BiocManager, quietly = TRUE)) install.packages(BiocManager) BiocManager::install(GDCRNATools) 下载好之后运行,以COAD数据为例,下载: library(GDCRNATools) gdcRNADownloa
TCGA-THYM-mRNA表达数据——胸腺瘤表达及临床数据集整理
浏览:179
5星 · 资源好评率100%
TCGA-THYM数据集已经整理成LCPM格式,临床数据已经汇总整理。 LCPM格式即log2(CPM+1)格式,现在认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式比较过时了。部分生信文章审稿人推荐使用此格式分析数据
结直肠癌TCGA+GEO数据库临床资料
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结直肠癌TCGA+GEO数据库临床资料 实时更新TCGA和GEO中结直肠癌的数据
panclassif:一种提高TCGA癌分类器性能的方法
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PanClassif:用于癌癌分类的机器学习分类器管道 这是一个完整的机器学习管道软件包,可用于TCGA癌症RNA-seq基因计数数据。 数据预购 使用TCGA2STAT下载TCGA癌症和正常样本 使用knn-smoothing对上述收集的数据进行平滑处理( ) 功能 featSelect(homepath,cancerpath,normalpath,k) 参量 homepath:(str)您
TCGA简易下载工具
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该工具可以简化TCGA数据库的下载步骤,合并TCGA数据库中下载的文件
TCGA免疫浸润_TCGA_perl脚本tcga_mRNA_merge.pl_perl整理tcga_
浏览:80
5星 · 资源好评率100%
好用就完了
CDR详细教程
浏览:45
CDR接触过设计的人都明白,里面有详细的教程网址及步骤!
TCGA-STAD-mRNA表达数据——胃癌表达及临床数据集整理
浏览:148
TCGA-STAD数据集已经整理成LCPM格式,临床数据已经汇总整理。 LCPM格式即log2(CPM+1)格式,现在认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式比较过时了。部分生信文章审稿人推荐使用此格式分析数据
TCGA-LAML-mRNA表达数据——急性白血病表达及临床数据集整理
浏览:160
5星 · 资源好评率100%
TCGA-LAML数据集已经整理成LCPM格式,临床数据已经汇总整理。 LCPM格式即log2(CPM+1)格式,现在认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式比较过时了。部分生信文章审稿人推荐使用此格式分析数据
TCGA-READ-mRNA表达数据——直肠癌表达及临床数据集整理
浏览:124
5星 · 资源好评率100%
TCGA-READ数据集已经整理成LCPM格式,临床数据已经汇总整理。 LCPM格式即log2(CPM+1)格式,现在认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式比较过时了。部分生信文章审稿人推荐使用此格式分析数据
TCGA-READ-mRNA表达数据(TPM)-直肠癌表达及临床数据集整理
浏览:137
3星 · 编辑精心推荐
需要自己变成log2(TPM+1)才能进行后续分析哦
TCGA-LGG-mRNA表达数据——低级别胶质瘤表达及临床数据集整理
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5星 · 资源好评率100%
TCGA-低级别胶质瘤数据集已经整理成LCPM格式,临床数据已经汇总整理。 LCPM格式即log2(CPM+1)格式,现在认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式比较过时了。部分生信文章审稿人推荐使用此格式分析数据
TCGA-OV-mRNA表达数据——卵巢癌表达及临床数据集整理
浏览:170
5星 · 资源好评率100%
TCGA-OV数据集已经整理成LCPM格式,临床数据已经汇总整理。 LCPM格式即log2(CPM+1)格式,现在认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式比较过时了。部分生信文章审稿人推荐使用此格式分析数据
TCGA-LUAD-mRNA表达数据——肺腺癌表达及临床数据集整理
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5星 · 资源好评率100%
TCGA-LUAD数据集已经整理成LCPM格式,临床数据已经汇总整理。 LCPM格式即log2(CPM+1)格式,现在认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式比较过时了。部分生信文章审稿人推荐使用此格式分析数据
TCGA-ESCA-mRNA表达数据——食管癌表达及临床数据集整理
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5星 · 资源好评率100%
TCGA-ESCA数据集已经整理成LCPM格式,临床数据已经汇总整理。 LCPM格式即log2(CPM+1)格式,现在认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式比较过时了。部分生信文章审稿人推荐使用此格式分析数据
临床数据中心建设方案
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tcga官方下载工具
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tcga官方下载工具 最近服务器不稳定 有时候下载很慢 如果很难下载可以试试从这里下载
数据挖掘与R语言代码
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数据挖掘与R语言代码,分享快乐,这是我在大学里下载的
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TCGA肺癌数据分析 该数据分析项目已在密歇根大学的2020年秋季我的Stats 600回归分析课程中完成。 分析的数据包含肺癌患者的样本以及不同的临床因素及其基因组信息。 在此分析中,我想回答以下问题:哪些mRNA基因表达与肺癌患者的生存时间最相关? 与其他种族,性别和年龄等临床因素相比,吸烟与肺癌患者的生存时间是否更紧密相关? 放射疗法是延长患者生存时间的有效手段吗?
TCGA-BLCA-mRNA表达数据(TPM)-膀胱癌表达及临床数据集整理
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需要自己变成log2(TPM+1)才能进行后续分析哦
TCGA-PRAD-LCPM表达数据——前列腺癌表达及临床数据集整理
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5星 · 资源好评率100%
TCGA-PRAD数据集已经整理成LCPM格式,临床数据已经汇总整理。 LCPM格式即log2(CPM+1)格式,现在认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式比较过时了。部分生信文章审稿人推荐使用LCPM格式分析数据,当然也有部分使用log2...
TCGA-PCPG-mRNA表达数据——嗜铬细胞瘤和副神经节瘤表达及临床数据集整理
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TCGA-PCPG数据集已经整理成LCPM格式,临床数据已经汇总整理。 LCPM格式即log2(CPM+1)格式,现在认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式比较过时了。部分生信文章审稿人推荐使用此格式分析数据
TCGA-CHOL-mRNA表达数据——胆管癌表达及临床数据集整理
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5星 · 资源好评率100%
TCGA-CHOL数据集已经整理成LCPM格式,临床数据已经汇总整理。 LCPM格式即log2(CPM+1)格式,现在认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式比较过时了。部分生信文章审稿人推荐使用此格式分析数据
TCGA-CESC-mRNA表达数据——宫颈鳞癌和腺癌表达及临床数据集整理
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5星 · 资源好评率100%
TCGA-CESC数据集已经整理成LCPM格式,临床数据已经汇总整理。 LCPM格式即log2(CPM+1)格式,现在认为log2(TPM+1)和log2(FPKM+1)格式比较过时了。部分生信文章审稿人推荐使用此格式分析数据
TCGA-STAD-mRNA表达数据(TPM)-胃癌表达及临床数据集整理
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5星 · 资源好评率100%
需要自己变成log2(TPM+1)才能进行后续分析哦
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郭逗
2023-07-29
这个文件的内容实用性很高,可以帮助大家快速提取需要的临床数据。
高中化学孙环宇
2023-07-29
这个文件的结构清晰简洁,使我能够迅速找到我需要的信息。
阿葱的葱白
2023-07-29
这个文件提供了丰富的TCGA临床数据,对研究者来说非常有价值。
老光私享
2023-07-29
通过这个文件,我能够轻松获取到所需的TCGA临床数据,节省了大量的时间和精力。
叫我叔叔就行
2023-07-29
使用这个文件可以轻松对TCGA临床数据进行分析和挖掘,对于我研究的进展非常有帮助。
胡二强
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